健康優良企業の認定は、健康経営の取組みに応じて、次の2段階により実施されます。 
Step1は、職場の健康づくりに取組む環境を整えていただく活動で、健康企業宣言の取組み内容をクリアすると、健康保険組合連合会東京連合会（以下、「東京連合会」という）が認定する「銀の認定証」が交付されます。 
Step2は、Step1に引き続き、職場の健康経営･健康づくりをさらに進め、安全衛生にも取り組むこととなります。取組み内容をクリアすると、健康企業宣言東京推進協議会（以下、「東京推進協議会」という）が認定する「金の認定証」が交付されます。 
なお、Step2で「金の認定証」が交付された企業については、東京推進協議が窓口となり「日本健康会議」に報告することが予定されています。